Aboubacar M. Tambadou, représentant du Tribunal international chargé des archives judiciaires (IRMCT), a confirmé la nouvelle dans un courrier adressé à la présidente de l’institution, Graciela Gatti Santana. Les documents officiels attestant du décès de Ndindabahizi survenu le 5 octobre ont été transmis aux autorités béninoises le 8 octobre 2025. 

Ndindabahizi a été reconnu coupable d’avoir soutenu et renforcé les attaques contre les Tutsi réfugiés sur le pont de Gitwa à deux reprises, entraînant la mort de milliers de personnes. Le TPIR, basé à Arusha en Tanzanie, avait conclu qu’il faisait partie des acteurs majeurs du génocide contre les Tutsi dans la préfecture de Kibuye.

Emmanuel Ndindabahizi, né en 1950 à Gitesi (actuel district de Karongi), a étudié à Kirambo, Nyagato, Shyogwe et au Collège Officiel de Kigali avant d’obtenir des diplômes en économie et administration à l’Université nationale du Rwanda (1974 et 1976).

En outre, il a exercé dans plusieurs institutions publiques et privées : directeur financier de la Coopérative Trafipro (1976–1981), d’Electrogaz (1981–1985), chef du département des finances intérieures au ministère de la Planification (1985–1991), puis conseiller chez Audico (1991–1992).

En 1992, Ndindabahizi a rejoint le Parti Social Démocrate (PSD) et est devenu Secrétaire exécutif de la section de Kibuye en 1993. La même année, il a été nommé directeur de cabinet du ministre des Finances, le deuxième poste le plus important du ministère. Le 9 avril 1994, il a été nommé ministre des Finances dans le gouvernement des « Sauveurs », fonction qu’il a occupée pendant le génocide contre les Tutsi.

Après la chute du gouvernement génocidaire en juillet 1994, il s’était réfugié à Goma, en République démocratique du Congo.

C’est en 2009, qu’il a été transféré au Bénin pour purger sa peine de réclusion à perpétuité.

Emmanuel Ndindabahizi, condamné pour génocide contre les Tutsi, est décédé à Cotonou, au Bénin